幕府在九州的战事全面溃败，德川家治无奈撤军退回日本的本岛跟四国的土地上作防御之态。
同月，江户动乱，德川家治只得还回江户坐镇，命本家将领德川富尔作为主帅，老中井上正经帮忙协调工作。。
燚军占领九州岛，消息一出，日本举国震动。
有兴奋期待的，也是沮丧悲观的。
那些跟幕府颇有仇恨的外样大名们此时也是逐渐起了异心，对于幕府的命令是阳奉阴违了起来。似乎只要幕府势弱，他们可以毫不犹豫的抛弃幕府转投到燚军麾下。
毕竟有了九州的各个藩国，如萨摩藩、大禹藩，秋肥藩等等投降燚军在前，让他们投降汉人，也不是什么不能接受的事情。
而一些颇有野心的大名则认为，这或许是自己的时机到来，他们可以假借幕府的命令，打着拥护天皇的名义，大肆的扩充武士军队，待幕府的军队跟燚军拼个你死我活之后，再出来坐收渔翁之利。
剩
下的就是幕府的御三家跟诸多的亲藩大名们，他们与幕府的关系是荣誉共损，共同进退，绝对不希望幕府倒台。
总而言之，日本局势混乱不堪，远远超出了幕府统治。
天择四年（乾隆二十五年）九月
燚朝联军宣布再次扩军，在燚朝各种扶持政策之下，日本各地众多的平民跟武士争相来投，甚至各个大名的武士也不例外，此时，主力兵力已达到了惊人的四万人。
同月，日本主岛爆发战乱，拥皇军与幕府军队开战。
为了保证政权，幕府军队回缩了在四国的兵力，把注意力集中在了主岛上。
可是由于燚朝的存在，幕府依旧不敢把所有的军队都放在对付拥皇军的身上。此时的幕府也只能亮出了自己的家底，再次调集了五万的幕府主力、协调三万的亲藩部队，企图一仗就破掉号称拥兵五十万的拥皇军。
随即双方军队在大阪城附近进行大大小小数十场的割据式的惨烈厮杀。
虽然拥皇军拥有着无比高昂的信仰力量，也拥有着气势如虹的士气，但是他们显现是太高看了自己，也太低估了幕府的军队，他们以为幕府军队在对阵燚军时一败再败就是腐朽无能，不堪一击。
但显然，他们这支仓促组建的拥皇军跟有着职业训练过的幕府军队还是没有办法比。要是有数十个外样大名的军事力量支撑着，这支拥有着数十万大军的拥皇军早就被幕府的军队击败。
而幕府的军队显示也是高看了自己，低估了敌人。以为拥皇军只是一群乌合之众，显然没有想到拥皇军的信念如此之顽强，在那些外样大名的指挥下也是跟己方的军队打得平分秋色。
当然，这主要还是因为幕府的主力部队还在防守着燚军。要不是因为燚军的存在，这所谓的拥皇军完全不是幕府的对手，要知道幕府拥有的直系军队跟御三家的部队就超过十八万，还没有算上亲藩那边的。
因为有燚军的存在，他们才完全腾不出更多的力量来，给予拥皇军致命的一击。
天择四年（乾隆二十五年）十月初
燚朝联军进攻了日本三岛中的第二个岛：四国
由于此时幕府还在主岛跟拥皇军打个你死我活的状态，无力再聚集力量抵抗燚军的入侵。没有了幕府的军队支持，四国岛上各藩国的大名哪里还有勇气抵抗来势汹汹的燚朝联军，便是投降的投降，逃跑的逃跑。
很快，日本四国再次被燚军攻破。</div>
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