最终，元起和诸葛亮商议过后，决定把张龙和邓芝留下来，负责稳定高句丽的局势，对境内各种事项进行整顿。张龙一战扬名，在高句丽人心中留下了不可磨灭的印记；邓芝政能出众，谋略过人，无论治政、治军都是一把好手，让他们两人联手治理高句丽，必然会让高句丽在短期内迸发出活力，并成为元起大军的坚固后盾。
至于高句丽军民的意愿，元起也做出了相应的决定。首先，对于自发的奉上钱粮的普通百姓，元起严令军士，不许拿取他们手中的一针一线，违令者严惩不贷；其次，那些拿起武器，自愿跟随元起北上征讨扶余的将士，元起也对他们进行了嘉奖和安抚，把其中大部分人都遣散，让他们留下来协同张龙、邓芝镇守丸都，只挑选出五千精锐随军北上。
整顿完毕之后，元起一刻也不肯再耽搁，立刻踏上了征程。平定高句丽，已经用去了十几天的时间，元起在此后有限的一个半月之内，还要相继平定扶余、击败东部鲜卑，留给他的时间相当的紧迫。
扶余比高句丽建立的时间还要长久，地域还要辽阔，很早之前，扶余人就建立起了自己的政权，并向元氏称臣，数百年来，对元氏帝国恭敬有加，并且得到了稳定且快速的发展，成为北疆一个举足轻重的政权。直到近几十年来，因为内战不休，奸佞当道，国力衰弱，扶余当代国主阿猛儿趁机断绝了和元氏帝国的往来，不再以属国自居，而是勾结辽东太守公孙度，霸占着北疆大量肥沃的土地，隐隐有自称一霸的趋势。
与高句丽不同，扶余人崇尚的是武力，想要征服扶余，根本就不可能像征服高句丽那样，仅仅凭借神迹这些就能取得最后的胜利，想要让扶余人臣服，必须依靠武力，把扶余人打疼了、打怕了，他们才会产生畏惧，才会乖乖的听话。
对此，元起也做足了心理准备，决心和扶余来一场硬碰硬的对决，争取一战而定。三日后，元起就从丸都城率军来到了和扶余交界的难水。一边策马狂奔，元起一边指着结冰的难水对诸葛亮说道：“孔明。这条江，就是难水了，此江上下游都比较狭窄，导致水流湍急；唯有中游地带较为开阔，江水至此才流向平缓。”
诸葛亮一直在思考怎么才能尽快平定扶余，听到元起的话之后，双眼中猛然一亮，面带欣喜之色对元起说道：“主公，我军的胜算，就要着落在这难水之上了。”元起闻言一怔，随即反应了过来，追问道：“孔明的意思是，半渡而击之？”
点了点头，诸葛亮又说道：“眼下是隆冬时节，扶余人世代生活在难水边，长久以来的习惯，必定会让扶余人认为，难水的冰面结实无比，我军大可在冰面上动些手脚，一战而击溃扶余主力。”
听着诸葛亮的分析，元起随即陷入了沉思之中。良久之后，元起忽然勒住了战马，坐下的玉麒麟猛然收力，后蹄坚定有力的插在地面上，一双前蹄高高扬起，载着元起在空中停顿了片刻之后，才重重的落下前蹄，激起一片尘土。
“传某军令，停止前进，在难水边选择最显眼、最醒目的地方扎营，要让难水对面的人能清楚的看到我军营内的一切动向。”
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