家康决定暂时居住于江户城，因为他真的已经开始对自己的继承人秀忠感到失望了。
可是，秀忠已经继任了二代目征夷大将军，已经不可能将他替换下来了。所以，家康决定在这段时间先住在江户，处理这边的后事与政务，让秀忠先冷静一段时间，好好反思自己的作为。
还有，既然秀忠令人失望，那就只能自己亲自来大力培养秀忠的儿子，也就是自己的嫡长孙竹千代作为下一代继承人了。这也是家康留在江户的原因之一。
现在，家康与他的妻妾还有孩子们居住于江户城的西之丸，还有处理政务。本丸则还是由秀忠夫妇居住。
家康在回到江户后，马上迅速着手处理城内的混乱。
他首先是暗中派出已经投诚于德川家的甲贺忍者高坂甚内去调查清楚了事情的起因于原委，然后再派人处理清了仍在城下町作乱的伊贺同心会一揆众残党。
在靠大量的散财以及安抚工作平定了秩序后，家康便派人开始了城下町的修复与流离失所的平民的安置工作。
于是，这场秀忠花了十天都没有解决的重大骚乱事件，在家康的老练手腕下，仅仅用了数日就几乎已经有恢复原状的样子了。只不过，西部与南部的城下町还是那片难以恢复的焦黑废墟，要重新修复还是必须要有几个年头的。
还有，江户城内的大半粮仓都因为这场大火而尽数烧毁，可谓是损失惨重。其中甚至包括了德川家的重要的兵粮粮仓。幸好北部还有一些粮仓安然无恙，并未被烧毁，要不然从现在这个粮食短缺的状况来看，那就真的是难以救济了。
而且，虽然家康以最快的速度处理了这件事，但江户城的元气大伤已经是无法挽回的事情了。要想完完全全恢复，那还真不是什么简单的事情。更何况，现在家康为了紧急补救城内的状况，也花费了积攒的大量金银。
家康随后还派出大量的人力去追捕已经逃走了的伊贺同心会首领服部正就。可是并没有找到他。估计应该是畏罪潜逃了吧。
面对近乎全灭的伊贺同心会，家康感到一阵无力。他现在只能将正就的弟弟，年轻的服部正重提拔上来，任命他为伊贺同心会的新首领，并继承“半藏”的名号，成为第四代目服部半藏，统领同心会最后剩下的寥寥数人。
至于扩充补齐同心会人才方面的事情，那也得花费大量的时间与精力，并非能短时间内办成，恢复回原来的实力。
在家康询问这些同心会残党时，他们都异口同声地回答道，是首领服部正就先对他们动手的，他们为了反抗，只能去江户城寻找将军秀忠解决问题，可是没想到将军不但不听，还派兵镇压，将他们及他们的亲人尽数杀害。
听出了他们口中的恨意的家康认为他们没有说谎。在经过调查之后他也了解到，这件事确实是因服部正就而起。四谷长善寺那边的鲜血与尸体很好的证明了这点。
至此，家康对同心会的处理与安抚复兴就到此为止。家康对本次大乱的罪魁祸首，伊贺同心会的原首领服部正就倒是下达了缉捕令。
除了安置平民修复城下町以及调查同心会以外，还有一件让家康非常头疼的事情。那就是关于外样大名们的屋敷被烧事件。
虽然并没有发生死人的事情，但是大名们的家属因此非常惊慌。
例如，被烧最严重的福岛家与黑田家的屋敷。福岛正则的两个幼子市松及利松，市松在逃跑时不小心摔伤了脚，而年幼的利松则是因为大火的烟熏而咳嗽不止。他们这还算不太严重的。黑田家那边，长政的嫡子万德丸则是受到了十足的惊吓，现在高烧不止。
除此之外，伊达，浅野等众多外样大名的屋敷都多多少少受到了火灾的牵连，损伤程度不一。这些大名们纷纷向德川家提出了质问，尤其是损失严重的福岛家与黑田家。
更麻烦的是，现在江户城的外样大名屋敷中，已经出现了类似于猜忌德川家的一类情况。因为担心与畏惧，外样大名们纷纷有联合抱团的这种意向和趋势。
现在，要处理这些外交问题，让家康很头疼。
总之，现在秀忠被勒令静养一些日子，以便其冷静身心。全部的政务都交由家康来处理。
此次被后人称为“庆长江户同心一揆”的重大骚乱，也就此正式地落下了帷幕。
家康现在，除了处理政务之外，还要去看看自己的嫡孙竹千代。因为乳母阿福报告他说，竹千代在这场骚动中也受到了不少惊吓。
竹千代是家康最喜欢的孙子，没有之一。所以在听说竹千代受到惊吓之后，家康马上万分火急地赶过去看望。
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